Des échantillons de chlorophylle à bord du NGCC Sir John Franklin ont été prélevés dans des bouteilles carrées calibrées d'environ 330 ml en PEHD à plusieurs profondeurs dans la zone euphotique. Des doublons pour tous les échantillons ont été prélevés lorsque cela était possible, car la variabilité entre les filtres peut être assez élevée. Chaque flacon d'échantillon a été soigneusement rincé trois fois (y compris le bouchon) avant le remplissage. Après 3 rinçages, les bouteilles ont été remplies, laissant le moins de place possible pour l'air. Un système de collecteur de filtration contenant 6 tours de filtration, le collecteur et un flacon de filtrat a été installé dans un environnement aussi sombre que possible. Avant de commencer la filtration, chaque tour était chargée d'un filtre GF/F de 25 mm. Le volume filtré est enregistré sur l'étiquette de l'échantillon et l'étiquette a été transférée du flacon d'échantillon au flacon à scintillation. Le filtre a été retiré après filtration (à l'aide d'une pince) et placé doucement dans le flacon à scintillation, côté échantillon vers le haut.
