Identification du stock génétique du saumon kéta de l'expédition du saumon 2019 dans le golfe d'Alaska (Copte)

10.1101/2021.05.27.445905

Données d'identification des stocks génétiques par séquençage du polymorphisme unique nucléotidique (SNP) effectué en mer pour le saumon coho récolté dans l'océan Pacifique Nord-Est. Ces données ont été recueillies dans le cadre de l'expédition en haute mer du golfe d'Alaska de l'Année internationale du saumon (IYS) menée en février et mars 2019, afin d'améliorer encore la compréhension des facteurs ayant une incidence sur la survie hivernale du saumon en début de mer. La technologie de génotype par séquençage sur le terrain a été utilisée pour l'identification du stock génétique par séquençage de polymorphisme à nucléotide unique (SNP GSI) de saumons utilisant le séquenceur de troisième génération MiniOn d'Oxford Nanopore Technologies. Les résultats sur le terrain seront validés avec les résultats répliqués au laboratoire de génomique de la station biologique du Pacifique, MPO, Nanaimo, C.-B., sur le flux de travail établi basé sur Ion-Torrent, ainsi que les données lues par l'un des individus marqués par fil codé inclus dans cette analyse.

Accès et utilisation

Licence: Licence Creative Commons 4.0 Attribution

Données et ressources

Citation

Mots clés

Étendue du jeu de données

Date(s) de référence des métadonnées September 11, 2023 (Publication)
September 10, 2024 (Revision)
Date(s) de référence des données February 18, 2019 (Création)
May 19, 2021 (Publication)
Fréquence de mise à jour Au besoin

Partie responsable 1
Affiliation
North Pacific Anadromous Fish Commission ROR logo
Courriel
secretariat@npafc.org
Rôle
Éditeur
Partie responsable 2
Nom
Deeg, Christoph
Affiliation
University of British Columbia ROR logo
Courriel
Christoph.Deeg@dfo-mpo.gc.ca
Rôle
  • Auteur
  • Dépositaire
  • Propriétaire
Partie responsable 3
Nom
Neville, Chrys
Affiliation
Fisheries and Oceans Canada ROR logo
Courriel
Chrys.Neville@dfo-mpo.gc.ca
Rôle
Auteur
Partie responsable 4
Nom
Waters, Charlie
Affiliation
National Oceanic and Atmospheric Administration ROR logo
Courriel
charlie.waters@noaa.gov
Rôle
Auteur
Partie responsable 5
Nom
Beacham, Terry
Affiliation
Fisheries and Oceans Canada ROR logo
Courriel
Terry.Beacham@dfo-mpo.gc.ca
Rôle
Auteur
Partie responsable 6
Nom
Urawa, Shigehiko
Affiliation
Tohoku National Fisheries Research Institute
Courriel
urawa@affrc.go.jp
Rôle
Auteur
Partie responsable 7
Nom
Beamish, Richard
Affiliation
Fisheries and Oceans Canada ROR logo
Courriel
rabeamish@shaw.ca
Rôle
Auteur
Partie responsable 8
Nom
Miller-Saunders, Kristi
Affiliation
Fisheries and Oceans Canada ROR logo
Courriel
Kristi.Saunders@dfo-mpo.gc.ca
Rôle
Chercheur principal
Partie responsable 9
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
data@hakai.org
Rôle
Distributeur

Champ Valeur
Variables océaniques Abondance et diversité de poissons
Portée Jeu de données
Statut Terminé
Note de maintenance Generated from https://hakaiinstitute.github.io/hakai-metadata-entry-form#/en/iys/MgLSkk3m0iXQyIRXEu0UL6y0BOo1/-Mh_6ITOOnz_bd7lmQEC
Étendue spatiale { "coordinates": [ [ [ -128.513667, 48.311 ], [ -143.000167, 56.668667 ], [ -147.503333, 56.667333 ], [ -147.500667, 47.668333 ], [ -136.997, 47.666833 ], [ -129.9175, 48.191167 ], [ -128.513667, 48.311 ] ] ], "type": "Polygon" }
Latitude limite Nord 47.666833
Latitude limite Sud 56.668667
Longitude limite Est -128.513667
Longitude limite Ouest -147.503333
Étendue temporelle
Début
2019-02-18
Fin
2019-03-14
Étendue verticale
Min
0.0
Max
40.0
Langue par défaut Anglais
Identifiant de citation
Code
https://doi.org/10.1101/2021.05.27.445905
Included in Data Catalogue
Included in Data Catalogue 1
Nom
SIOOC - Pacifique Catalogue
Description
Accueil des données canadiennes sur l'océan Pacifique
URL
https://catalogue.cioospacific.ca
Included in Data Catalogue 2
Nom
North Pacific Anadromous Fish Commission
Description
 
URL
https://data.npafc.org