Échantillons de concentrations de chlorophylle et de phéopigment en vrac et en fractionnement de taille de l'Institut Hakai prélevées à l'aide de bouteilles Niskin, provisoire

10.21966/90h6-b497

Cet ensemble de données comprend les concentrations de chlorophylle et de phaeopigment de l'Institut Hakai recueillies de 2015 à aujourd'hui dans les stations de l'île Calvert, du détroit de Johnstone et des régions étudiées de l'île Quadra. Des échantillons pour ces données ont été recueillis sur le terrain à l'aide de bouteilles Niskin. L'échantillon d'eau (250 ml) a été filtré à travers : 1) un seul filtre en fibre de verre (GF/F, taille nominale des pores 0,7 um) pour comprendre une mesure globale des concentrations de phytoplancton chlorophylle et de phaeopigment et 2) une pile de filtres (filtres en polycarbonate GF/F, 3 um et 20 um) pour estimer la chlorophylle et le phéopigment les concentrations de pico, de nano et de micro-phytoplancton, respectivement. Les filtres ont été extraits pendant 24 heures dans 10 ml d'acétone à 90 % et analysés sur des fluoromètres de laboratoire Turner Designs Trilogy à l'aide du module d'acidification et selon la méthode de Holm Hansen et al. (1965).

Les données ont été contrôlées par une inspection manuelle, qui comprenait une comparaison des concentrations en vrac avec la somme des concentrations de filtres fractionnés par taille. Le cas échéant, d'autres comparaisons ont été effectuées avec d'autres mesures des concentrations de chlorophylle, y compris la fluorescence de la chlorophylle CTD in situ et les données de chromatographie liquide à haute performance (HPLC).

Les données ont été recueillies par les programmes océanographiques et côtiers de l'Institut Hakai.

Accès et utilisation

Licence: Licence Creative Commons 4.0 Attribution
Limites: The utilized acidification method is sensitive to interference by high concentrations of chlorophyll c and b. High chlorophyll c concentrations can cause a slight overestimation of chlorophyll a and an underestimation of phaeopigments: negative phaeopigment concentrations can occur during bloom events with high chlorophyll c and healthy phytoplankton. High chlorophyll b concentrations can result in underestimations of chlorophyll a and overestimations of phaeopigments. When chlorophyll b is high relative to chlorophyll a, chlorophyll a can be underestimated by as much as 2.5 fold. For more details see Welschmeyer et al. (1994). These two types of interference likely had an influence on the published chlorophyll and phaeopigment dataset. Notably, comparison with HPLC has shown that stations in the Quadra Island region often experience conditions where chlorophyll b is present in high concentrations and is high relative to chlorophyll a. The acidification method used to analyze the Hakai Institute dataset has been shown to highly overestimate phaeopigment concentrations based on comparison to concentrations determined by HPLC (Trees et al., 2003). Care should be used when interpreting the published phaeopigment concentrations. Prior to 2021, samples that exceeded the manufacturer specified instrument sensitivity range were not diluted to bring their concentrations within the specified range. Samples run above the instrument sensitivity range may have underestimated chlorophyll concentrations due to the blockage of light passing through the sample and a corresponding reduction of fluorescence output (see Turner Trilogy user manual for complete description). Comparison with matching HPLC derived chlorophyll a suggests that the affected samples may be useable, but further analysis is required. This provisional dataset includes these data. Prior to 2018, annual calibrations of the Hakai Institute Turner Trilogy benchtop fluorometers showed variability in the calibration slopes and acid ratios that were applied to the data. The inconsistent nature of this variability suggests error due to analytical methods rather than instrument drift. As a result, the chlorophyll and phaeopigment concentrations of the data where these calibrations were applied may have error as high as +/- 12 % from this source alone. These data have been included in this provisional dataset. Prior to 2018, QA/QC analysis suggests potential influence by acid contamination on the chlorophyll and phaeopigment concentrations (i.e. very low chlorophyll a and high phaeopigment concentrations where the CTD fluorometer and HPLC showed high chlorophyll a). In 2018, methodological controls were put in place to limit acid contamination and the issue ceased. Care has been taken to flag the contaminated data, but data with less obvious contamination effects may not have been captured by QA/QC and may be present in this provisional dataset. This provisional dataset includes all data flagged as "suspicious" (show suspicious trends, but may not be incorrect), but excludes data flagged as "discard" (clearly erroneous).

Données et ressources

Citation

Mots clés

Étendue du jeu de données

Date(s) de référence des métadonnées July 12, 2024 (Publication)
July 12, 2024 (Revision)
Date(s) de référence des données July 10, 2014 (Création)
January 13, 2022 (Publication)
Fréquence de mise à jour Au besoin

Partie responsable 1
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Rôle
  • Distributeur
  • Propriétaire
  • Éditeur
Partie responsable 2
Nom
Del Bel Belluz, Justin ORCID logo
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
justin.belluz@hakai.org
Rôle
  • Auteur
  • Dépositaire
  • Initiateur
  • Point de contact
  • Chercheur principal
  • Éditeur
  • Fournisseur de ressources
Partie responsable 3
Nom
Fedje, Bryn
Affiliation
Hakai Institute ROR logo
Courriel
bryn.fedje@hakai.org
Rôle
  • Dépositaire
  • transformateur
  • Éditeur
  • Contributeur
Partie responsable 4
Affiliation
Tula Foundation ROR logo
Rôle
Fondateur

Champ Valeur
Variables océaniques Matière particulaire
Portée Jeu de données
Statut En cours
Note de maintenance Generated from https://hakaiinstitute.github.io/hakai-metadata-entry-form#/en/hakai/7U7b8oPpeTN6gjvXlUCTGJr5pga2/-McQFPAf457LB4-SWmyL
Étendue spatiale { "coordinates": [ [ [ -128.5, 52.27 ], [ -127.4, 52.21 ], [ -127.2, 51.66 ], [ -125.6, 51.13 ], [ -124.8, 50.96 ], [ -124.1, 50.43 ], [ -124.7, 49.98 ], [ -124.9, 49.8 ], [ -126.7, 50.45 ], [ -128.1, 51.37 ], [ -128.4, 51.69 ], [ -128.5, 52.27 ] ] ], "type": "Polygon" }
Latitude limite Nord 49.8
Latitude limite Sud 52.27
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Longitude limite Ouest -128.5
Étendue temporelle
Début
2014-07-10
Étendue verticale
Min
0.0
Max
650.0
Langue par défaut Anglais
Identifiant de citation
Code
https://doi.org/10.21966/90h6-b497
Projects
  1. Oceanography
Included in Data Catalogue
Included in Data Catalogue 1
Nom
SIOOC - Pacifique Catalogue
Description
Accueil des données canadiennes sur l'océan Pacifique
URL
https://catalogue.cioospacific.ca
Included in Data Catalogue 2
Nom
Hakai Data Catalogue
Description
Science on the Coastal Margin
URL
https://catalogue.hakai.org