Dans le cadre de l'Initiative internationale sur les bassins versants, sous la supervision de la Commission mixte internationale (CMI), la Commission des voies navigables internationales de Sainte-Croix a procédé à des prélèvements réguliers des eaux de surface dans les stations du bassin versant de Sainte-Croix en mettant l'accent sur les niveaux de nutriments. Les échantillons ont été soumis au Laboratoire d'essais environnementaux de l'Atlantique (ALET) d'Environnement et Changement climatique Canada (ECCC) et au Laboratoire d'essais environnementaux du Québec (QLET). L'échantillonnage a été effectué dans tout le cours principal de la rivière Sainte-Croix, dans les lacs d'amont et dans de nombreux affluents principaux afin de représenter la couverture spatiale, et a également été effectué tout au long des saisons pour représenter la variance temporelle.